کارگاه های نسل سوم

بیوانفورماتیک کاربردی

مقدمه
بیوانفورماتیک، تقاطع زیست‌شناسی، آمار و علوم کامپیوتر است که داده‌های زیستی حجیم (توالی‌ها، بیان ژن، ساختارها) را تحلیل می‌کند و به استخراج معنا می‌پردازد.

 

تاریخچه و شکل‌گیری

آغاز با بانک‌های توالی (GenBank)، توسعه الگوریتم‌های جستجوی توالی (BLAST توسط Altschul و همکاران، 1990) و رشد انفجار داده‌های توالی پس از NGS.

 

اسامی کلیدی

David Lipman, Stephen Altschul (BLAST)، و پژوهشگرانی که بانک‌های داده و ابزارها را ساختند.

 

مباحث پایه

پایگاه‌های داده توالی (GenBank, UniProt)، الگوریتم‌های تطبیق و جفت‌سازی، مقدمات آنالیز بیان (RNA-seq pipeline)، مقدمه‌ای بر آنالیز ساختار و پیش‌بینی عملکرد.

 

تغییرات اخیر

افزایش استفاده از NGS، متدهای یادگیری ماشین برای پیش‌بینی عملکرد ژن‌ها/پپتیدها، ابزارهای کاربرپسند تحت وب و پایتون/R برای آنالیز.

 

بازارکار و چشم‌انداز

نقش کلیدی در بیوتکنولوژی، تشخیص مولکولی، داروسازی و شرکت‌های داده‌محور زیستی؛ تقاضا برای مهارت‌های تحلیل داده، برنامه‌نویسی و درک زیست‌شناسی مولکولی در حال رشد است.

 

منابع پیشنهادی
کتاب‌های مقدماتی بیوانفورماتیک، آموزش‌های NCBI، مستندات BLAST، کورس‌های Python/R برای بیوانفورماتیک.

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *